Znanstvenoistraživački, stručni i proizvodni rad organiziran je kroz osam znanstvenih odjela, dvije službe i jednu radnu jedinicu:

  • Odjel za oplemenjivanje i genetiku strnih žitarica
  • Odjel za oplemenjivanje i genetiku kukuruza
  • Odjel za oplemenjivanje i genetiku industrijskog bilja
  • Odjel za oplemenjivanje i genetiku krmnog bilja
  • Odjel za voćarstvo
  • Odjel za sjemenarstvo
  • Odjel za poljoprivrednu tehniku i melioracije
  • Odjel – Agrokemijski  laboratorij
  • Služba općih poslova
    • Odsjek za osiguravanje i unaprjeđivanje kvalitete
  • Financijska služba
  • Radna jedinica Sjemensko dobro